RNA editering i hjärnan

Forskningen i Marie Öhmans grupp fokuseras på RNA editering och dess funktion i däggdjurets hjärna. Modifiering av adenosin till inosin (A till I) är den vanligaste typen av RNA editering hos däggdjur. Denna process katalyseras av en familj adenosin deaminaser (ADAR) som känner igen adenosiner i dubbeltrådigt RNA och konverterar dem till inosiner. Eftersom I läses som G (guanosin) i cellen blir effekten av editeringen en funktionell A till G förändring. Denna editering möjliggör därför förändringar i mRNA-koden så att aminosyrasekvensen ändras vid protein syntesen. Även icke-kodande RNA molekyler så som mikroRNA kan editeras av ADAR enzymerna.

En av huvudfrågorna som forskargruppen vill besvara är hur dessa RNA substrat känns igen för editering i vår hjärna. Tusentals adenosinbaser i repetitiva element editeras i hjärnan. Ett antal editerinsställen har även hittats i transkript som kodar för gener som uttrycks i det centrala nervsystemet. Trots detta är det fortfarande oklart under vilka betingelser editering sker.

En annan viktig frågeställning som gruppen arbetar med är hur editeringen bidrar till en ökad variation av transkriptomet under nervcellens utveckling och stimulering.

För fler detaljer om projekten i forskargruppen se den engelska versionen
 

Utvalda publikationer

Daniel, C., Venö, M., Ekdahl, Y., Kjems, J., & Öhman, M. (2012). A distant cis acting intronic element induces site-selective RNA editing. Nucleic Acids Res. 40(19):9876-86

Ekdahl, Y., Farahani, H.S., Behm, M., Lagergren, J., & Öhman, M. (2012). A-to-I editing of microRNAs in the mammalian brain increases during development. Genome Res. 22(8):1477-87

Silberberg, G., Lundin, D., Navon, R., & Öhman, M. (2012). Deregulation of the A-to-I RNA editing mechanism in psychiatric disorders. Human Molecular Genetics. 21(2):311-21

Daniel, C., Wahlstedt, H., Ohlson, J., Björk, P., & Öhman, M. (2011). Adenosine-to-inosine RNA editing affects trafficking of the gamma-aminobutyric acid type A (GABA(A)) receptor. J Biol Chem. 286(3):2031-40

Wahlstedt, H., Daniel, C., Ensterö, M., & Öhman, M. (2009). Large-scale mRNA sequencing determines global regulation of RNA editing during brain development. Genome Research. 19:978-86