Kollegiet består av en ordförande som utses av rektor efter samråd med prorektor och vicerektorer, tre ledamöter utsedda av Områdesnämnden för humaniora, juridik och samhällsvetenskap, tre ledamöter utsedda av Områdesnämnden för naturvetenskap samt två ledamöter utsedda av Stockholms universitets studentkår. En ledamot utsedd av Institutionen för pedagogik och didaktik (IPD) och en ledamot utsedd av Institutionen för data- och systemvetenskap (DSV) har närvaro- och yttranderätt. Avdelningen för högskolepedagogik vid IPD utför kanslifunktionerna för kollegiet.