En viktig mekanism för evolution är naturligt urval; individer varierar i olika egenskaper vilka är ärftliga och denna variation leder varierande framgång i olika miljöer. Studiet av evolutionen kan inkludera allt från rekonstruktion av historiska och evolutionära mönster till studiet av de pågående processer som ger upphov till evolution.
Forskningen vid Stockholms universitet fokuserar på flera evolutionära aspekter, bland annat släktskapsrekonstruktion, egenskapers evolution, biogeografi, artbildning, hybridisering, artinteraktioner, selektion (urval) i naturliga populationer, samt hur variation i naturlig selektion är kopplad till miljön.
