Elina ViinamäkiForskningsingenjör
Om mig
Jag jobbar som laboratorie chef och forskningsingenjör på ACESx; exponering och effekter.
Jag har huvudansvar för våra levande kulturer som bl.a. innefattar små kräftdjur, gröna mikroalger och kromister. Jag är involverad i olika studentprojekt där jag hjälper till att sätta upp experiment och ge guidning i labbarbete. Jag ser även till att instrumenten fungerar som de ska och att de får service.
Jag är fältansvarig för miljöövervakningens provtagning av amfipoder i Östersjöns bottensediment.
Inom miljöövervakningsgruppen håller jag på att träna upp mig i embryoanalys på amfipoda kräftdjur, särskilt Monoporeia.
Ytterligare ett intresse är molekylärbiologi, jag har jobbat en hel del med extrahering av DNA/RNA, amplifiering och förberederlse för sekvensering.
Även mikroskopi, eDNA, bioinformatic och djur är områden av intresse.
Jag har en svensk magisterexamen i biologi och en masterexamen i marinbiologi.
Jag har gjort två stora intressanta forskningsarbeten; ett via Zoologiska institutionen och Naturhistoriska Riksmuseet där jag kombinerade morfologiska och molekylära metoder för att särskilja och taxonomiskt bestämma arter av rockor. I det andra arbetet via institutionen för ekologi, miljö och botanik,fick jag ett stipendium av SIDA för att samla in planktonprover i olika akvatiska habitat på Zanzibar. Planktonproverna analyserade jag på SU och använde molekylära metoder för att identifiera fisklarver. Detta för att kartlägga hur olika fiskarter använder olika habitat som barnkammare.
Forskningsprojekt
Publikationer
I urval från Stockholms universitets publikationsdatabas
-
Population genetics of the hound needlefish Tylosurus crocodilus (Belonidae) indicate high connectivity in Tanzanian coastal waters
2023. Said S. Mgeleka (et al.). Marine Biology Research 19 (4-5), 261-270
ArtikelLäs mer om Population genetics of the hound needlefish Tylosurus crocodilus (Belonidae) indicate high connectivity in Tanzanian coastal watersThe hound needlefish Tylosurus crocodilus (Belonidae) is a highly demanded fish in the local markets of Tanzania, but the growing coastal population threatens its sustainability. As belonids are highly migratory fishes utilising various parts of the seascape, increased fishing pressure may disrupt connectivity patterns on different spatiotemporal scales and disaggregate populations. Using the COI gene, this study assessed the genetic population structure, connectivity patterns, and historical demography of T. crocodilus collected in seven sites spread along Tanzanian coastal waters. Results showed fourteen haplotypes with low overall nucleotide and haplotype diversity. Pairwise FST comparisons revealed no significant differences among the sampled sites, except for the northernmost site (Tanga) and an island in the south (Songosongo). Analysis of molecular variance (AMOVA) revealed a non-significant genetic structure among populations (FST = 0.01782), suggesting the fishery across Tanzanian waters exploits the same population. Moreover, there was no correlative relationship between genetic and pairwise geographic distances, rejecting the isolation by distance hypothesis. However, neutrality tests and mismatch distribution analysis revealed that recent demographic expansion might exist. Empirical evidence of panmixia suggests high genetic connectivity. In combination with low genetic diversity, management should be directed to actions that prevent genetic diversity loss and the effect of genetic drift on populations.
Visa alla publikationer av Elina Viinamäki vid Stockholms universitet
Levande kulturer
Fältarbete
Inköpare
KLARA ansvarig