Koen JurgensDoktorand

Proteiner är stora biomolekyler som underlättar cellulära processer i organismer. Dessa kan man se som människor i ett samhälle: var och en har ett specifikt jobb som håller saker och ting löpande. Proteinernas strukturer är väldigt komplexa, men genom att analysera dem i detalj så kan vi lära oss hur de samverkar med andra molekyler eller proteiner. I vårt labb använder vi kryoelektronmikroskopi (cryo-EM) för att lösa proteinstrukturer på atomnivå. Mitt projekt fokuserar på hur olika antikroppar binder till specifika målstrukturer. När en patogen, t.ex. en bakterie eller ett virus, invaderar våra kroppar, svarar vårt immunsystem genom att producera antikroppar för att neutralisera den attackerande sjukdomen. Antikropparna riktar sig ofta mot de proteiner som finns på patogenernas cellyta, där några är mycket viktiga för att underlätta patogenens intåg in i cellen. Vissa patogener har dock hittat sätt att överrumpla eller undvika vårt immunsystem, och då behöver vi läkemedel och/eller vacciner för att överleva eller övervinna infektionen utan att få permanenta skador. Med andra ord måste vi förstå hur antikroppar binder till och neutraliserar patogenernas ytproteiner. För att uppnå detta måste ytproteinerna först isoleras och sen kombineras med renade antikroppar från blodserum. Därefter borde vi kunna hitta alla positioner där antikroppar binder målstrukturen med hjälp av cryo-EM. Dessutom skulle vi också kunna tillämpa denna strategi för autoimmuna sjukdomar, i situationer där producerade antikroppar riktar sig mot våra egna friska celler, vävnader och proteiner. Med denna kunskap skulle nya antikroppar kunna utvecklas inom läkemedelsbranschen, som i sin tur kan användas mot sjukdomar orsakade av bakterier och virus, som det inte finns några effektiva behandlingarna mot i nuläget.