Zareen KhanPostdoktor
Om mig
Jag är postdoktor vid Stockholms universitet på enheten för exponering och effekter.
Min nuvarande forskning fokuserar på miljö-DNA-adduktomik, där jag utvecklar och tillämpar högupplösta LC-MS-baserade arbetsflöden för att upptäcka DNA-modifieringar som biomarkörer för genotoxisk exponering. Jag har bidragit till metodinnovationer inklusive dispersiv fastfasextraktion (d-SPE) för att förbättra analytisk känslighet i komplexa biologiska matriser. Mitt arbete med prover från fisklever och amfipoder från Östersjön, under det svenska nationella marina övervakningsprogrammet, har lett till identifiering av olika genotoxiska, epigenetiska och oxidativa stressmarkörer. Min bredare expertis spänner över livsmedelsföroreningar, metabolomik och fytokemisk profilering med både riktade och icke-riktade omics-metoder.
Jag tog min doktorsexamen i biokemi från Pune University (Indien), där jag tillämpade avancerade analytiska metoder och högupplöst masspektrometri för att studera bioaktiva fytokemikalier och deras hälsofrämjande egenskaper i druvor och härledda produkter. Avhandlingen bidrog till att förbättra förståelsen och kunskapen om förekomsten, bioaktiviteten och hälsokonsekvenserna av fytokemikalier, samt att utveckla analytiska metoder för identifiering och kvantifiering av dem. Det gav värdefulla insikter om närings- och näringspotentialen hos druvor härledda föreningar, vilket stödde deras tillämpning inom livsmedels- och hälsovetenskap.
Vissa publikationer listas nedan, men mina karriärpublikationer är lättast tillgängliga på Google Scholar.
Undervisning
Under min postdoktorala forskning vid Stockholms universitet bidrog jag till undervisningen i masterprogrammet genom att hålla föreläsningar om Toxikologi för miljöforskare. Min undervisning fokuserade specifikt på ADME (Absorption, Distribution, Metabolism och Excretion) och biotransformationsprocesser, vilket ger eleverna en mekanistisk förståelse för hur miljöföroreningar interagerar med biologiska system. Dessa sessioner betonade det toxikokinetiska beteendet hos föroreningar och deras konsekvenser för miljöhälsan och riskbedömning.
Publikationer
I urval från Stockholms universitets publikationsdatabas
-
Simultaneous RNA and DNA Adductomics Using Single Data-Independent Acquisition Mass Spectrometry Analysis
2023. Giulia Martella (et al.). Chemical Research in Toxicology 36 (9), 1471-1482
ArtikelLäs mer om Simultaneous RNA and DNA Adductomics Using Single Data-Independent Acquisition Mass Spectrometry AnalysisAdductomics studies are used for the detection and characterizationof various chemical modifications (adducts) of nucleic acids and proteins.The advancements in liquid chromatography coupled with high-resolutiontandem mass spectrometry (HRMS/MS) have resulted in efficient methodsfor qualitative and quantitative adductomics. We developed an HRMS-basedmethod for the simultaneous analysis of RNA and DNA adducts in a singlerun and demonstrated its application using Baltic amphipods, usefulsentinels of environmental disturbances, as test organisms. The noveltyof this method is screening for RNA and DNA adducts by a single injectionon an Orbitrap HRMS instrument using full scan and data-independentacquisition. The MS raw files were processed with an open-source program, nLossFinder, to identify and distinguish RNA and DNA adductsbased on the characteristic neutral loss of ribonucleosides and 2 & PRIME;-deoxyribonucleosides,respectively. In the amphipods, in addition to the nearly 150 putativeDNA adducts characterized earlier, we detected 60 putative RNA adducts.For the structural identification of the detected RNA adducts, theMODOMICS database was used. The identified RNA adducts included simplemono- and dimethylation and other larger functional groups on differentribonucleosides and deaminated product inosine. However, 54 of theseRNA adducts are not yet structurally identified, and further workon their characterization may uncover new layers of information relatedto the transcriptome and help understand their biological significance.Considering the susceptibility of nucleic acids to environmental factors,including pollutants, the developed multi-adductomics methodologywith further advancement has the potential to provide biomarkers fordiagnostics of pollution effects in biota.
Visa alla publikationer av Zareen Khan vid Stockholms universitet