Forskningsprojekt AdaptiveTarget: Effektivare analys av komplex haplotypvariation
Genetisk variation vid resistensgener är avgörande för en hållbar avkastning av grödor, eftersom ett varmare klimat förväntas leda till ökade angrepp av skadedjur och sjukdomsalstrande organismer.
Trots de senaste framstegen inom storskalig DNA-sekvensering förblir resistensgener och andra komplexa genomiska regioner svåra att studera. Begränsningarna hos nuvarande metoder utgör ett hinder för vår förmåga att använda genetisk information för växtförädling.
Detta projekt syftar till att utveckla AdaptiveTarget, en metod baserad på långläsnings-sekvensering av specifika områden i arvsmassan. Denna metod gör det möjligt för forskare och växtförädlare att snabbt, effektivt och kostnadseffektivt få fram haplotypinformation på populationsnivå för komplexa genomiska regioner såsom resistensgener och självinkompatibilitetsloci i växter.
Projektmedlemmar
Projektansvariga
Tanja Slotte
Professor
Medlemmar
Marco Fracassetti
Forskare
Aleksandra Losvik
Forskningsingenjör
